《斗罗大陆2绝世唐门》动漫版为适配动画叙事节奏、受众审美等，对小说版的剧情线、角色塑造、情感线等多方面进行了大量调整，部分改编还引发了原著党的争议。
核心情感线的简化与调整
1.主角纯爱线强化：
小说中霍雨浩的情感线较复杂，他在王冬儿（唐舞桐）和王秋儿间摇摆不定，还与橘子有着暧昧纠葛，比如橘子曾主动亲吻霍雨浩，王秋儿对他的深情也有大量铺垫。而动漫几乎删减了所有暧昧情节，橘子的告别改成简单互动，王秋儿的情感铺垫大幅减少，聚焦强化霍雨浩与唐舞桐的纯爱主线。同时，原著中唐舞桐会因霍雨浩和其他女生走近而吃醋，心理活动丰富，动漫里她的情绪波动被弱化，显得较为冷淡。
2.配角情感线缩水：
小说里史莱克七怪中还有叶骨衣暗恋霍雨浩、王仙儿为霍雨浩治疗情伤等支线情节，叶骨衣和南秋秋甚至有约定放弃霍雨浩的名场面。这些内容在动漫中均被一笔带过，配角的情感刻画基本被舍弃。
角色人设的强化与崩坏
1.王秋儿相关魔改争议大：
这是动漫争议最大的人设改动。原著中王秋儿因容貌来历不明被史莱克全员警惕调查，还曾装聋作哑抢魂环引发队友不满。但动漫弱化了全员警惕的设定，仅保留王冬儿的警惕；为凸显她，还将队友指责的情节改成王冬儿的独角戏，甚至把原著中霍雨浩等人的高光技能挪给她。此外，原著中王秋儿明知自己献祭会引发兽潮却毫不在意，动漫则篡改这一设定，让古月娜为其行为背书，掩盖其主观恶意。
2.正反角色人设简化：
小说里日月帝国太子徐天然是城府极深的权谋高手，野心与手段都暗藏于温和外表下；而动漫将其塑造成满脑子打杀杀的暴力狂，完全丢掉了其权谋属性。主角霍雨浩在小说中存在情感摇摆的争议点，动漫则删掉争议台词和情节，洗白了他可能引发争议的“渣男”属性。另外，原著中许久久因犯错不仅当众认错，还私下向戴浩下跪请罪，尽显上位者担当，动漫删减了下跪情节，使其形象变得单薄，戴浩后续继续效力的动机也变得牵强。
关键剧情的删减、增补与逻辑改动
1.剧情删减导致逻辑断层：
小说中唐雅黑化是循序渐进的，从被铁血门报复到武魂变异，再到被圣灵教洗脑，逻辑完整；动漫直接快进到她失忆重伤贝贝，没看过原著的观众难以理解其黑化缘由。还有原著中霍雨浩炸日月帝国武器库有完整前因后果，动漫简化成他一时冲动的行为，让战争爆发的因果关系模糊。此外，相思断肠红的考验、霍雨浩帮徐三石追江楠楠等推动角色关系或体现角色性格的情节，也被动漫直接删减。
2.新增原创角色与情节：
动漫中新增了轩梓文、季绝尘加盟唐门的相关情节，以此丰富唐门魂导科技发展和战术配合的剧情线，这是小说中没有的设定。同时还为了突出王秋儿，给她增加了独立时长超13分钟的打戏，而主角团和其他史莱克七怪的剧情反而被压缩。
3.盟友关系改编引逻辑硬伤：
原著中史莱克没支援本体宗，是因对其战况一无所知，且认为本体宗战力强悍无需驰援，属于情理之中。但动漫改为史莱克明明收到本体宗的求救传信，知晓毒不死被围攻、天魂帝国濒临灭亡，却选择置之不理，彻底打破了史莱克学院作为“正义标杆”的人设，引发观众对剧情逻辑的质疑。
设定呈现的详略差异
1.魂灵体系铺垫不同：
小说中魂灵体系的出现有完整的递进过程，从雪女胚胎自爆，到伊莱克斯出手将其本源转化为魂灵，每个环节都详细交代了来龙去脉，凸显这一设定的开创性。动漫虽保留了核心情节，但为加快节奏，简化了天梦冰蚕、冰帝与雪帝之间的关联铺垫，不过动态漫版本补充了天梦冰蚕和冰帝的恩怨细节，让魂灵体系的形成更易被观众理解。
2.武魂融合技设定弱化：
小说中霍雨浩与王冬儿的“浩冬三绝”强调需天生契合才能触发，凸显其稀有性。动漫虽为该融合技制作了震撼特效，但弱化了“天生契合”的设定，使得新观众难以体会到这个武魂融合技的特殊之处。